雅安市人民政府于1999年5月以“雅署函〔99〕24号”批准建立了“宝兴河珍稀鱼类市级自然保护区”。 雅安市人民政府2004年5月20日以“雅府函〔2004〕68号”进行了调整。

调整后宝兴河珍稀鱼类市级自然保护区位于雅安市宝兴县宝兴河，河道总长132km，面积760公顷，流域面积908km²。主要保护对象为：重口裂腹鱼、异唇裂腹鱼、宝兴裸裂尻鱼、青石爬鮡、四川鮡、大鲵等。

核心区：华能硗碛电站库区以上的波日沟、新寨子沟、瓦斯沟，河道总长51公里，面积306公顷，流域面积460km²。

缓冲区：华能硗碛电站水库库区，河道总长21公里，面积130公顷，流域面积160km²。

实验区：华能硗碛电站大坝以下至县城两河口河段干流和锅巴岩沟、邓池沟，河道总长60公里，面积324公顷，流域面积288km²。